Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLSPNQ9HAW4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLSPNQ9HAW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms