Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms