Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAE3

EFCAB1, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB1Q9HAE3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB1Q9HAE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB1Q9HAE3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB1Q9HAE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB1Q9HAE3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB1Q9HAE3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB1Q9HAE3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB1Q9HAE3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB1Q9HAE3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EFCAB1Q9HAE3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB1Q9HAE3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms