Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TDRD3Q9H7E2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD3Q9H7E2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms