Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPF2Q9H7B2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms