Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STN1Q9H668 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms