Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SMOC1Q9H4F8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMOC1Q9H4F8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms