Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRN3Q9H3W5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms