Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD1Q9H3U5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms