Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.184e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.194e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.224e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 PDXK-215ENST00000476313 1704 ntTSL 318.51■□□□□ 0.557e-7■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 WDR45B-203ENST00000571817 889 ntTSL 319.14■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 WDR45B-208ENST00000574828 765 ntTSL 314.92□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 WDR45B-205ENST00000572583 2322 ntTSL 1 (best)13.88□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 WDR45B-206ENST00000573616 896 ntTSL 513.47□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.186e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DBN1-207ENST00000477391 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.01■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DBN1-206ENST00000472831 2667 ntTSL 215.32■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DBN1-209ENST00000506117 477 ntTSL 414.47□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DBN1-208ENST00000505550 534 ntTSL 213.07□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DBN1-211ENST00000514833 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 411.97□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 USP34-207ENST00000463046 6307 ntTSL 25.74□□□□□ -1.496e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 USP34-203ENST00000436269 1827 ntTSL 54.47□□□□□ -1.696e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 USP34-202ENST00000411912 4309 ntTSL 53.7□□□□□ -1.826e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 TMEM74B-203ENST00000481747 582 ntTSL 226.34■■□□□ 1.814e-16■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DCAF5-204ENST00000553943 736 ntTSL 316.99■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DCAF5-206ENST00000554681 759 ntTSL 211.73□□□□□ -0.539e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DCAF5-207ENST00000556111 728 ntTSL 311.13□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DCAF5-202ENST00000389997 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.729e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.139e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 412.8□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 FBXL3-202ENST00000417323 1093 ntTSL 525.57■■□□□ 1.685e-8■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 FBXL3-204ENST00000472949 329 ntTSL 524.76■■□□□ 1.555e-8■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.385e-8■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.25e-8■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.255e-8■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.325e-8■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.685e-8■■■■■ 26.8
CSTF2TQ9H0L4 CDK19-207ENST00000468997 1083 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.229e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 CDK19-205ENST00000460913 448 ntTSL 511.95□□□□□ -0.59e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 CDK19-204ENST00000457688 955 ntTSL 510.04□□□□□ -0.89e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.189e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.66e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-225ENST00000489897 998 ntTSL 517.96■□□□□ 0.476e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.466e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.466e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.436e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.436e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.396e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.386e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-230ENST00000530154 1670 ntTSL 216.85■□□□□ 0.296e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.166e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.176e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.56e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.746e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-210ENST00000361746 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.816e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-229ENST00000528371 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.886e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.886e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)9.24□□□□□ -0.936e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.936e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.986e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.996e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.016e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.026e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.026e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.056e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.056e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.056e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.066e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.196e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.236e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 56.78□□□□□ -1.326e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.386e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.386e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.576e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 LTBP4-211ENST00000594537 657 ntTSL 521.28■■□□□ 17e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 LTBP4-227ENST00000600026 723 ntTSL 320.22■□□□□ 0.837e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 LTBP4-224ENST00000599016 726 ntTSL 320.03■□□□□ 0.87e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 LTBP4-208ENST00000593738 302 ntTSL 317.9■□□□□ 0.467e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 LTBP4-223ENST00000598717 811 ntTSL 517.69■□□□□ 0.427e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 315.72■□□□□ 0.112e-7■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 312.59□□□□□ -0.392e-7■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 FZR1-207ENST00000591290 1331 ntTSL 518.32■□□□□ 0.524e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.314e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 FZR1-208ENST00000592214 598 ntTSL 315.2■□□□□ 0.024e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.234e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 BLVRB-203ENST00000597870 1392 ntTSL 517.32■□□□□ 0.362e-18■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.12e-18■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.472e-18■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.252e-8■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 516.7■□□□□ 0.263e-9■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 GLE1-202ENST00000372770 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.791e-7■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 GLE1-201ENST00000309971 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.051e-7■■■■□ 26.7
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-235ENST00000584860 1109 ntTSL 312.75□□□□□ -0.373e-11■■■■□ 26.6
CSTF2TQ9H0L4 KCTD15-203ENST00000587559 622 ntTSL 414.63□□□□□ -0.075e-7■■■■□ 26.6
CSTF2TQ9H0L4 SEPT5-208ENST00000431124 920 ntTSL 514.51□□□□□ -0.091e-7■■■■□ 26.6
CSTF2TQ9H0L4 ADRM1-202ENST00000462554 735 ntTSL 324.01■■□□□ 1.436e-8■■■■□ 26.6
CSTF2TQ9H0L4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.026e-8■■■■□ 26.6
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