Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF541Q9H0D2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF541Q9H0D2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF541Q9H0D2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms