Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C20orf27Q9GZN8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C20orf27Q9GZN8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms