Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM6Q9C030 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms