Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXQ1Q9C009 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXQ1Q9C009 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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