Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRY4Q9C004 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms