Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP1Q9C000 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NLRP1Q9C000 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.76■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NLRP1Q9C000 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms