Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1BQ9BZX4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms