Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TM6SF1Q9BZW5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM6SF1Q9BZW5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms