Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM5DQ9BY66 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5DQ9BY66 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5DQ9BY66 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms