Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC46A2Q9BY10 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC46A2Q9BY10 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms