Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUSAP1Q9BXS6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUSAP1Q9BXS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NUSAP1Q9BXS6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms