Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGPP1Q9BX95 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms