Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KATNB1Q9BVA0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms