Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDC1Q9BTX1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC1Q9BTX1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms