Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms