Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERPUD2Q9BSE4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms