Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3BQ9BS92 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP3BQ9BS92 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP3BQ9BS92 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms