Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22CQ9BRL7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22CQ9BRL7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms