Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms