Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS7

HEPH, Hephaestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEPHQ9BQS7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HEPHQ9BQS7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HEPHQ9BQS7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms