Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms