Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF18Q99633 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms