Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK15Q96Q40 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK15Q96Q40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms