Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RILPQ96NA2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms