Protein–RNA interactions for Protein: Q96MP5

ZSWIM3, Zinc finger SWIM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM3Q96MP5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM3Q96MP5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM3Q96MP5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM3Q96MP5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM3Q96MP5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM3Q96MP5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM3Q96MP5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM3Q96MP5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZSWIM3Q96MP5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZSWIM3Q96MP5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZSWIM3Q96MP5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM3Q96MP5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZSWIM3Q96MP5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZSWIM3Q96MP5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM3Q96MP5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM3Q96MP5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM3Q96MP5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM3Q96MP5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms