Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNIP3Q96KP6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNIP3Q96KP6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms