Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJD4Q96KN9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJD4Q96KN9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GJD4Q96KN9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms