Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MS4A4AQ96JQ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MS4A4AQ96JQ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms