Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAMP1Q96JM3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAMP1Q96JM3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms