Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX3Q96JJ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMX3Q96JJ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms