Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG1Q96JA1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms