Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
APIPQ96GX9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APIPQ96GX9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APIPQ96GX9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms