Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCARF2Q96GP6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms