Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
LTV1Q96GA3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
LTV1Q96GA3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms