Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHFRQ96EP1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHFRQ96EP1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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