Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEURL3Q96EH8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEURL3Q96EH8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms