Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF501Q96CX3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF501Q96CX3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF501Q96CX3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms