Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRAMD1AQ96CP6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1AQ96CP6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms