Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMAQ96B86 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGMAQ96B86 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGMAQ96B86 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGMAQ96B86 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGMAQ96B86 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMAQ96B86 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMAQ96B86 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms