Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEAL3Q969E4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms